Em 12 de setembro, Mem de Sá se aparelhava na cidade para a campanha final, o que se efetuou logo. Foram destruídas cento e trinta e tantas aldeias e arrasadas as roças depois de grande mortandade. As referencias a local são tão vagas que não podemos situar com precisão o sítio da "guerra". Mas a testemunha Luis da Costa, diz que para iniciar a destruição tiveram os expedicionários que subir uma serra "de subidas mui altas e ásperas".
Donde conjeturamos tratar-se do planalto da Muritiba como por sua vez o governador afirma ter contornado o Paraguassu, pode-se acreditar que a penetração começou na foz do rio, banda do sul (hoje São Roque), descendo em Muritiba para sair na Cachoeira.
Foram terríveis as represálias de Mem de Sá que os nativos não mais se levantaram, e as pazes pedidas foram definitivas. Em carta a El Rey o governador geral podia dizer que nunca estivera tão pacífico o Recôncavo e que as terras conquistadas valiam um reino não só pela extensão como pela fertilidade. [Carta de Mem de Sá de 31 de março de 1560] [Página 7]
A não ser que eu esteja convencido pelo testemunho das Escrituras ou pela razão clara pois não confio nem no papa ou em concílios por si sós, pois é bem sabido que eles frequentemente erraram e se contradisseram) sou obrigado pelas Escrituras que citei e minha consciência é prisioneira da palavra de Deus. Não posso e não irei renegar nada, pois não é nem seguro e nem correto agir contra a consciência. Que Deus me ajude. Amém.