José Bonifácio ocupou a cátedra de Metalurgia, especialmente criada para ele, na Universidade de Coimbra, por Carta Régia15/04/1801
José Bonifácio foi nomeado intendente-geral das Minas e Metais do Reino, e membro do Tribunal de Minas18/05/1801
José Bonifácio recebeu o encargo de administrar as antigas minas de carvão de Buarcos (Mina do Cabo Mondego) e restabelecer as abandonadas fundições de ferro de Figueiró dos Vinhos e Avelar08/07/1801
José Bonifácio foi feito diretor do Real Laboratório da Casa da Moeda de Lisboa e incumbido de remodelar o estabelecimento12/11/1801
