Pernambuco aderiu rapidamente ao príncipe regente, mas na Bahia a situação continuava séria e, a 15 de junho, D. Pedro enviou carta em que mandava o general Madeira embarcar sem demora para Portugal. Foi necessário enviar uma expedição contra ele e, como comandante, José Bonifácio indicou o general francês Pedro Labatut que já havia submetido a província de Sergipe.