Ao desembarcar de Trípoli, John Adams, ainda sob o comando de Rodgers, ousadamente atacou os fortes e as canhoneiras ancoradas sob sua proteção. Vários dias depois, ela capturou o cruzador tripolitano de 28 armas Meshuda. Depois que o USS New York e o USS Enterprise se juntaram a ela, John Adams enfrentou uma flotilha de canhoneiras inimigas ao largo de Trípoli em 22 de maio, enviando-os correndo de volta ao porto em segurança. Cinco dias depois - com o apoio adicional de USS Adams, uma fragata irmã também nomeada em homenagem ao presidente John Adams - o esquadrão novamente derrotou um grupo de canhoneiras piratas.