Em 1645, todos os herdeiros da coroa portuguesa passaram a ser chamados de príncipes e Teodósio, filho de D. João IV, ganhou o título de "Príncipe do Brasil". Sendo assim, o país sul-americano tornou-se um Principado e ganhou sua primeira bandeira particular.

O símbolo mostrava um fundo branco com uma esfera armilar ao centro, instrumento usado no aprendizado da arte da navegação. Além disso, a bandeira voltou a ter uma Cruz da Ordem de Cristo nela.