Sua volta a Sorocaba ocorre por ocasião da morte de seu pai em 1818, impedindo a continuidade de seus estudos, já que teria que se tornar chefe de sua família e substituiria seu pai à frente dos negócios, inclusive como tesoureiro da Real Fábrica de Ferro São João do Ypanema e na administração do Registro de Animais. Seu ingresso oficial na política foi em 1821 e 10 anos depois é nomeado Presidente da Província de São Paulo:
Ao prestígio é nomeado, por Ato de 3 de abril de 1831, Presidente da Província de São Paulo. Governaria a província por três anos e meio de 17 de novembro de 1831 a 11 de maio de 1835), sendo o governante imperial de São Paulo que mais tempo ficou no poder (LEITE, 1965, p.08).
No início de sua administração criou o corpo de guardas chamado de GuardaMunicipal Permanente, composto por cem praças e uma seção de cavalaria com trintasoldados e um tenente, que depois viria dar origem à Polícia Militar do Estado de São Paulo.Na sessão do Conselho da Província, de 15 de dezembro de 1831, opresidente Rafael Tobias de Aguiar sugere a criação de um corpo deguardas, a pé e a cavalo, composto de cem praças, uma seção decavalaria com trinta soldados e um tenente: a Guarda MunicipalPermanente- origem da Polícia Militar do Estado de São Paulo (LEITE,1965, pg.09).Desta forma, a denominação do Distrito é devida ao seu ilustre fundador emorador, que além de político e militar possuía uma estância no sul do país e também eradono de duas famosas fazendas de gado na rota dos tropeiros: a Parnapitanga, emItapetininga; e a São Pedro, em Itararé, além de ter seu nome atribuído a uma raça de cavalos,o crioulo ou também conhecido como “tobiano”, graças à preferência do Brigadeiro por essaraça para a montaria. [Página 34]