Segundo as informações do historiador Monsenhor Paulo Florêncio da Silveira Camargo, sabemos que, por volta de 1640, André Fernandes decidereceber novos sacerdotes em sua vila. Nessa época a igreja matriz [de Parnaíba] ia sentindo efeito do tempo, sendo de taipa, a umidade foi-lhe atacando fortemente. Ainda mais estando perto do rio, no tempo das enchentes, sofria os efeitos da cheia e por isso era de difícil acesso aos fregueses. André Fernandes quis reedificá-la com o povo, em outro lugar mais alto e melhor situado, sobranceiro à Vila adjacente, espalhada ao derredor. Enquanto se construía a nova Igreja, passou a matriz a funcionar na capela, imediações das antigas escolas reunidas. Pensava André Fernandes em trazer novos sacerdotes para Parnaíba. Não tinha amizade com os jesuítas, nem estavam nessa época em boa paz com os paulistas. Com a publicação do Breve do Papa Urbano VIII que entregava a direção dos índios exclusivamente aos jesuítas, os paulistas ficaram desatinados. Romperam em franca hostilidade contra a Companhia de Jesus. Pensaram então os parnaibanos nos beneditinos. Fizeram-lhes convite, com promessa de doação de terras para o estabelecimento de residência monacal. (CAMARGO, 1971, p. 106).