Mas a grande expansão das atividades de mineração em outras regiões terminoupor levar ao despovoamento e à estagnação da Capitania, que foi extinta pelo governoportuguês e depois reativada em 1765, sob a administração de Morgado de Mateus.É neste período que o Engenheiro Militar José Custódio de Sá e Faria faz seulevantamento da cidade de São Paulo até o Presídio de Nossa Senhora dos Prazeres no RioIguatemi, e da mesma cidade até a vila de Paranaguá, nos anos de 1774