Os trabalhos da Comissão Hidráulica se iniciaram no dia 31 de julho de 1879, quando seusmembros partiram da cidade do Rio de Janeiro rumo a Maceió. Daí, depois de ultimar todosos preparativos, começaram a subir o rio São Francisco a 12 de agosto, alcançando a cidadede Pirapora (MG) a 13 de dezembro, após percorrer cerca de 2.100 quilômetros desde a fozdo rio. Por ordem de William Milnor Roberts, Teodoro Sampaio fez o caminho de volta,descendo o rio até a cidade de Carinhanha (BA), de onde seguiu para cruzar a região daChapada Diamantina a fim de estudar sua geografia física e humana e sua capacidadeprodutiva. No desempenho desses trabalhos, demorou-se de 25 de dezembro de 1879 a 30de janeiro de 1880, quando rumou para Salvador, onde chegou a 3 de fevereiro e seencontrou com os outros membros da comissão.