Francisco faleceu em 1624, em São Paulo, SP. Em seu testamento, Francisco deixou:

- Casas na vila, de dois lanços.
- Uma casa em Piratininga, de dois lanços.
- Duas casas velhas na roça e seus pertences.
- Roças.
- Quatro porcos.
- Galinhas.
- Móveis.
- Tralhas de uso doméstico.
- Ferramentas.
- Roupas de homem e de mulher.